Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms