Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms