Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bop1P97452 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Bop1P97452 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Bop1P97452 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bop1P97452 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bop1P97452 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bop1P97452 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bop1P97452 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bop1P97452 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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