Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Irf3P70671 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irf3P70671 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irf3P70671 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irf3P70671 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irf3P70671 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irf3P70671 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irf3P70671 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irf3P70671 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irf3P70671 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irf3P70671 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irf3P70671 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irf3P70671 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irf3P70671 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irf3P70671 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irf3P70671 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Irf3P70671 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Irf3P70671 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Irf3P70671 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Irf3P70671 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Irf3P70671 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Irf3P70671 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Irf3P70671 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Irf3P70671 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Irf3P70671 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Irf3P70671 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irf3P70671 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Irf3P70671 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Irf3P70671 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Irf3P70671 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irf3P70671 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irf3P70671 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irf3P70671 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Irf3P70671 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irf3P70671 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Irf3P70671 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Irf3P70671 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Irf3P70671 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irf3P70671 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irf3P70671 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irf3P70671 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Irf3P70671 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Irf3P70671 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irf3P70671 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Irf3P70671 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf3P70671 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf3P70671 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Irf3P70671 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Irf3P70671 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf3P70671 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf3P70671 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Irf3P70671 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf3P70671 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Irf3P70671 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf3P70671 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms