Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcanP55066 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcanP55066 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcanP55066 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NcanP55066 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcanP55066 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NcanP55066 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NcanP55066 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NcanP55066 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcanP55066 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcanP55066 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcanP55066 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcanP55066 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NcanP55066 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcanP55066 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcanP55066 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcanP55066 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcanP55066 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcanP55066 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcanP55066 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcanP55066 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcanP55066 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcanP55066 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcanP55066 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcanP55066 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcanP55066 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcanP55066 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NcanP55066 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NcanP55066 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NcanP55066 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NcanP55066 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NcanP55066 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NcanP55066 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcanP55066 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcanP55066 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcanP55066 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcanP55066 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcanP55066 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcanP55066 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcanP55066 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcanP55066 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcanP55066 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NcanP55066 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NcanP55066 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NcanP55066 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NcanP55066 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NcanP55066 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NcanP55066 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcanP55066 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcanP55066 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcanP55066 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcanP55066 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcanP55066 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcanP55066 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcanP55066 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcanP55066 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcanP55066 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcanP55066 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NcanP55066 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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