Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fcer1aP20489 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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