Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18533 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18533 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18533 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18533 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18533 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18533 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18533 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18533 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18533 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18533 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18533 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P18533 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18533 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18533 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18533 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18533 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18533 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18533 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18533 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18533 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18533 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18533 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18533 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18533 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18533 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18533 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P18533 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18533 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18533 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18533 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P18533 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P18533 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P18533 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P18533 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P18533 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18533 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18533 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18533 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18533 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
P18533 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18533 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18533 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
P18533 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18533 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18533 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18533 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18533 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18533 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18533 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18533 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18533 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18533 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18533 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18533 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
P18533 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18533 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18533 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
P18533 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18533 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18533 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18533 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18533 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18533 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18533 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18533 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18533 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18533 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18533 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18533 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18533 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18533 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18533 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18533 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms