Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P10404 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
P10404 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P10404 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P10404 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P10404 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P10404 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P10404 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P10404 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P10404 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P10404 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P10404 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P10404 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P10404 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P10404 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
P10404 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P10404 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P10404 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P10404 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P10404 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P10404 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms