Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxa5P09021 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms