Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Spta1P08032 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spta1P08032 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spta1P08032 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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Spta1P08032 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Spta1P08032 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spta1P08032 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spta1P08032 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Spta1P08032 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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