Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcP06800 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprcP06800 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprcP06800 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprcP06800 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprcP06800 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprcP06800 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprcP06800 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprcP06800 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms