Protein–RNA interactions for Protein: P06335

T-cell receptor gamma chain C region 5/10-13, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06335 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06335 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06335 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06335 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06335 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06335 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06335 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06335 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06335 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06335 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06335 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06335 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06335 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06335 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06335 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06335 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06335 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06335 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06335 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P06335 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06335 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06335 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06335 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06335 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06335 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06335 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06335 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06335 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06335 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06335 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P06335 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06335 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06335 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06335 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06335 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P06335 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P06335 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P06335 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06335 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06335 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06335 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06335 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06335 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06335 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06335 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06335 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06335 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06335 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06335 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06335 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06335 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06335 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06335 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms