Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcn2O88968 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms