Protein–RNA interactions for Protein: O88554

Parp2, Poly [ADP-ribose] polymerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp2O88554 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp2O88554 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp2O88554 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp2O88554 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Parp2O88554 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp2O88554 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp2O88554 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp2O88554 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp2O88554 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Parp2O88554 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms