Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hps1O08983 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Hps1O08983 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hps1O08983 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hps1O08983 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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