Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Efna3O08545 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Efna3O08545 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Efna3O08545 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Efna3O08545 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Efna3O08545 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms