Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf1bp1B2KF50 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms