Protein–RNA interactions for Protein: A2A825

Rsg1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsg1A2A825 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rsg1A2A825 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms