Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc112A0AUP1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc112A0AUP1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc112A0AUP1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc112A0AUP1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc112A0AUP1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc112A0AUP1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc112A0AUP1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc112A0AUP1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc112A0AUP1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc112A0AUP1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc112A0AUP1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc112A0AUP1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ccdc112A0AUP1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc112A0AUP1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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