Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tulp1Q9Z273 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tulp1Q9Z273 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tulp1Q9Z273 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tulp1Q9Z273 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tulp1Q9Z273 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tulp1Q9Z273 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tulp1Q9Z273 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tulp1Q9Z273 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tulp1Q9Z273 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tulp1Q9Z273 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tulp1Q9Z273 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tulp1Q9Z273 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tulp1Q9Z273 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tulp1Q9Z273 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tulp1Q9Z273 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tulp1Q9Z273 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tulp1Q9Z273 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tulp1Q9Z273 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tulp1Q9Z273 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tulp1Q9Z273 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tulp1Q9Z273 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Tulp1Q9Z273 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tulp1Q9Z273 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tulp1Q9Z273 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tulp1Q9Z273 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tulp1Q9Z273 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tulp1Q9Z273 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tulp1Q9Z273 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tulp1Q9Z273 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tulp1Q9Z273 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tulp1Q9Z273 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tulp1Q9Z273 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tulp1Q9Z273 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tulp1Q9Z273 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tulp1Q9Z273 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tulp1Q9Z273 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tulp1Q9Z273 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tulp1Q9Z273 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tulp1Q9Z273 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tulp1Q9Z273 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tulp1Q9Z273 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tulp1Q9Z273 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tulp1Q9Z273 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tulp1Q9Z273 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tulp1Q9Z273 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tulp1Q9Z273 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tulp1Q9Z273 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tulp1Q9Z273 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tulp1Q9Z273 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tulp1Q9Z273 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tulp1Q9Z273 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tulp1Q9Z273 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tulp1Q9Z273 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tulp1Q9Z273 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tulp1Q9Z273 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tulp1Q9Z273 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms