Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn6Q9Z262 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms