Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0M6

Cd97, CD97 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd97Q9Z0M6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd97Q9Z0M6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd97Q9Z0M6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd97Q9Z0M6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd97Q9Z0M6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd97Q9Z0M6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd97Q9Z0M6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd97Q9Z0M6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd97Q9Z0M6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd97Q9Z0M6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd97Q9Z0M6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd97Q9Z0M6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd97Q9Z0M6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd97Q9Z0M6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd97Q9Z0M6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd97Q9Z0M6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd97Q9Z0M6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd97Q9Z0M6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd97Q9Z0M6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd97Q9Z0M6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd97Q9Z0M6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd97Q9Z0M6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd97Q9Z0M6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd97Q9Z0M6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd97Q9Z0M6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd97Q9Z0M6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd97Q9Z0M6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd97Q9Z0M6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd97Q9Z0M6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd97Q9Z0M6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd97Q9Z0M6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd97Q9Z0M6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd97Q9Z0M6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd97Q9Z0M6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd97Q9Z0M6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd97Q9Z0M6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd97Q9Z0M6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd97Q9Z0M6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd97Q9Z0M6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd97Q9Z0M6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd97Q9Z0M6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd97Q9Z0M6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd97Q9Z0M6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd97Q9Z0M6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd97Q9Z0M6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd97Q9Z0M6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd97Q9Z0M6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd97Q9Z0M6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd97Q9Z0M6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd97Q9Z0M6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cd97Q9Z0M6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cd97Q9Z0M6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cd97Q9Z0M6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cd97Q9Z0M6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cd97Q9Z0M6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd97Q9Z0M6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cd97Q9Z0M6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd97Q9Z0M6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd97Q9Z0M6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd97Q9Z0M6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd97Q9Z0M6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd97Q9Z0M6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd97Q9Z0M6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd97Q9Z0M6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd97Q9Z0M6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd97Q9Z0M6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd97Q9Z0M6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd97Q9Z0M6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd97Q9Z0M6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd97Q9Z0M6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd97Q9Z0M6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd97Q9Z0M6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd97Q9Z0M6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd97Q9Z0M6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd97Q9Z0M6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd97Q9Z0M6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd97Q9Z0M6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd97Q9Z0M6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd97Q9Z0M6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd97Q9Z0M6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd97Q9Z0M6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd97Q9Z0M6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd97Q9Z0M6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd97Q9Z0M6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd97Q9Z0M6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd97Q9Z0M6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd97Q9Z0M6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd97Q9Z0M6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd97Q9Z0M6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd97Q9Z0M6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd97Q9Z0M6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd97Q9Z0M6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd97Q9Z0M6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd97Q9Z0M6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd97Q9Z0M6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd97Q9Z0M6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd97Q9Z0M6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd97Q9Z0M6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd97Q9Z0M6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd97Q9Z0M6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms