Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0L1

S1pr4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1pr4Q9Z0L1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
S1pr4Q9Z0L1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
S1pr4Q9Z0L1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
S1pr4Q9Z0L1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
S1pr4Q9Z0L1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
S1pr4Q9Z0L1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
S1pr4Q9Z0L1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
S1pr4Q9Z0L1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
S1pr4Q9Z0L1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
S1pr4Q9Z0L1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
S1pr4Q9Z0L1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
S1pr4Q9Z0L1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
S1pr4Q9Z0L1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
S1pr4Q9Z0L1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
S1pr4Q9Z0L1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
S1pr4Q9Z0L1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
S1pr4Q9Z0L1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
S1pr4Q9Z0L1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
S1pr4Q9Z0L1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
S1pr4Q9Z0L1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
S1pr4Q9Z0L1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
S1pr4Q9Z0L1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
S1pr4Q9Z0L1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
S1pr4Q9Z0L1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
S1pr4Q9Z0L1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
S1pr4Q9Z0L1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
S1pr4Q9Z0L1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
S1pr4Q9Z0L1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
S1pr4Q9Z0L1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
S1pr4Q9Z0L1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
S1pr4Q9Z0L1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
S1pr4Q9Z0L1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
S1pr4Q9Z0L1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
S1pr4Q9Z0L1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
S1pr4Q9Z0L1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
S1pr4Q9Z0L1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
S1pr4Q9Z0L1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
S1pr4Q9Z0L1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
S1pr4Q9Z0L1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
S1pr4Q9Z0L1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
S1pr4Q9Z0L1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
S1pr4Q9Z0L1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
S1pr4Q9Z0L1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
S1pr4Q9Z0L1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
S1pr4Q9Z0L1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
S1pr4Q9Z0L1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
S1pr4Q9Z0L1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
S1pr4Q9Z0L1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
S1pr4Q9Z0L1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
S1pr4Q9Z0L1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
S1pr4Q9Z0L1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
S1pr4Q9Z0L1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
S1pr4Q9Z0L1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
S1pr4Q9Z0L1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
S1pr4Q9Z0L1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
S1pr4Q9Z0L1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
S1pr4Q9Z0L1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
S1pr4Q9Z0L1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
S1pr4Q9Z0L1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
S1pr4Q9Z0L1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
S1pr4Q9Z0L1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
S1pr4Q9Z0L1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
S1pr4Q9Z0L1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
S1pr4Q9Z0L1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
S1pr4Q9Z0L1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
S1pr4Q9Z0L1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
S1pr4Q9Z0L1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
S1pr4Q9Z0L1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
S1pr4Q9Z0L1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
S1pr4Q9Z0L1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
S1pr4Q9Z0L1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
S1pr4Q9Z0L1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
S1pr4Q9Z0L1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
S1pr4Q9Z0L1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
S1pr4Q9Z0L1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
S1pr4Q9Z0L1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
S1pr4Q9Z0L1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
S1pr4Q9Z0L1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
S1pr4Q9Z0L1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
S1pr4Q9Z0L1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
S1pr4Q9Z0L1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
S1pr4Q9Z0L1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
S1pr4Q9Z0L1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
S1pr4Q9Z0L1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
S1pr4Q9Z0L1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
S1pr4Q9Z0L1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
S1pr4Q9Z0L1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
S1pr4Q9Z0L1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
S1pr4Q9Z0L1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
S1pr4Q9Z0L1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
S1pr4Q9Z0L1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
S1pr4Q9Z0L1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
S1pr4Q9Z0L1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
S1pr4Q9Z0L1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
S1pr4Q9Z0L1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
S1pr4Q9Z0L1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
S1pr4Q9Z0L1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
S1pr4Q9Z0L1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
S1pr4Q9Z0L1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
S1pr4Q9Z0L1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms