Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn3Q9Z0G9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn3Q9Z0G9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn3Q9Z0G9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn3Q9Z0G9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn3Q9Z0G9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn3Q9Z0G9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn3Q9Z0G9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn3Q9Z0G9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn3Q9Z0G9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn3Q9Z0G9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn3Q9Z0G9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn3Q9Z0G9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn3Q9Z0G9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn3Q9Z0G9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn3Q9Z0G9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn3Q9Z0G9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn3Q9Z0G9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn3Q9Z0G9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn3Q9Z0G9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn3Q9Z0G9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn3Q9Z0G9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn3Q9Z0G9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn3Q9Z0G9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn3Q9Z0G9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn3Q9Z0G9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn3Q9Z0G9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn3Q9Z0G9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn3Q9Z0G9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cldn3Q9Z0G9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn3Q9Z0G9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn3Q9Z0G9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn3Q9Z0G9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn3Q9Z0G9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn3Q9Z0G9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn3Q9Z0G9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn3Q9Z0G9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn3Q9Z0G9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn3Q9Z0G9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn3Q9Z0G9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn3Q9Z0G9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn3Q9Z0G9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn3Q9Z0G9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn3Q9Z0G9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn3Q9Z0G9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn3Q9Z0G9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn3Q9Z0G9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn3Q9Z0G9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn3Q9Z0G9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn3Q9Z0G9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn3Q9Z0G9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn3Q9Z0G9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn3Q9Z0G9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn3Q9Z0G9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn3Q9Z0G9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn3Q9Z0G9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn3Q9Z0G9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn3Q9Z0G9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn3Q9Z0G9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn3Q9Z0G9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn3Q9Z0G9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn3Q9Z0G9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn3Q9Z0G9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn3Q9Z0G9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn3Q9Z0G9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn3Q9Z0G9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cldn3Q9Z0G9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cldn3Q9Z0G9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn3Q9Z0G9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn3Q9Z0G9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn3Q9Z0G9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn3Q9Z0G9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn3Q9Z0G9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn3Q9Z0G9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn3Q9Z0G9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn3Q9Z0G9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn3Q9Z0G9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn3Q9Z0G9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn3Q9Z0G9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn3Q9Z0G9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn3Q9Z0G9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn3Q9Z0G9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn3Q9Z0G9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn3Q9Z0G9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn3Q9Z0G9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn3Q9Z0G9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn3Q9Z0G9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn3Q9Z0G9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn3Q9Z0G9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn3Q9Z0G9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn3Q9Z0G9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn3Q9Z0G9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn3Q9Z0G9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn3Q9Z0G9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn3Q9Z0G9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn3Q9Z0G9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn3Q9Z0G9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms