Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ptpn4Q9WU22 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ptpn4Q9WU22 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn4Q9WU22 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn4Q9WU22 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn4Q9WU22 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn4Q9WU22 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpn4Q9WU22 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpn4Q9WU22 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpn4Q9WU22 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpn4Q9WU22 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpn4Q9WU22 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpn4Q9WU22 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpn4Q9WU22 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpn4Q9WU22 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpn4Q9WU22 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpn4Q9WU22 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn4Q9WU22 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn4Q9WU22 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn4Q9WU22 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn4Q9WU22 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn4Q9WU22 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn4Q9WU22 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn4Q9WU22 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn4Q9WU22 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn4Q9WU22 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn4Q9WU22 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn4Q9WU22 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn4Q9WU22 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn4Q9WU22 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptpn4Q9WU22 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptpn4Q9WU22 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptpn4Q9WU22 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptpn4Q9WU22 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptpn4Q9WU22 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptpn4Q9WU22 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptpn4Q9WU22 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptpn4Q9WU22 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptpn4Q9WU22 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptpn4Q9WU22 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptpn4Q9WU22 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptpn4Q9WU22 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptpn4Q9WU22 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptpn4Q9WU22 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptpn4Q9WU22 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn4Q9WU22 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn4Q9WU22 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn4Q9WU22 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn4Q9WU22 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn4Q9WU22 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn4Q9WU22 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn4Q9WU22 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptpn4Q9WU22 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptpn4Q9WU22 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptpn4Q9WU22 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptpn4Q9WU22 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptpn4Q9WU22 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms