Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psmb3Q9R1P1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psmb3Q9R1P1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb3Q9R1P1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmb3Q9R1P1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmb3Q9R1P1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb3Q9R1P1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb3Q9R1P1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb3Q9R1P1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb3Q9R1P1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb3Q9R1P1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb3Q9R1P1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb3Q9R1P1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb3Q9R1P1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb3Q9R1P1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb3Q9R1P1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb3Q9R1P1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb3Q9R1P1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb3Q9R1P1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb3Q9R1P1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb3Q9R1P1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb3Q9R1P1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb3Q9R1P1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb3Q9R1P1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb3Q9R1P1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb3Q9R1P1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb3Q9R1P1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb3Q9R1P1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb3Q9R1P1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb3Q9R1P1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb3Q9R1P1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb3Q9R1P1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb3Q9R1P1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb3Q9R1P1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb3Q9R1P1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb3Q9R1P1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb3Q9R1P1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb3Q9R1P1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb3Q9R1P1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb3Q9R1P1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb3Q9R1P1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb3Q9R1P1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb3Q9R1P1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb3Q9R1P1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb3Q9R1P1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb3Q9R1P1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb3Q9R1P1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb3Q9R1P1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb3Q9R1P1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb3Q9R1P1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb3Q9R1P1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb3Q9R1P1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb3Q9R1P1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb3Q9R1P1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb3Q9R1P1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb3Q9R1P1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb3Q9R1P1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb3Q9R1P1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb3Q9R1P1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb3Q9R1P1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms