Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Lamc3Q9R0B6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Lamc3Q9R0B6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
Lamc3Q9R0B6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Lamc3Q9R0B6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Lamc3Q9R0B6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Lamc3Q9R0B6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Lamc3Q9R0B6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Lamc3Q9R0B6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Lamc3Q9R0B6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Lamc3Q9R0B6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
Lamc3Q9R0B6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Lamc3Q9R0B6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Lamc3Q9R0B6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Lamc3Q9R0B6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Lamc3Q9R0B6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Lamc3Q9R0B6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Lamc3Q9R0B6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Lamc3Q9R0B6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Lamc3Q9R0B6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Lamc3Q9R0B6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Lamc3Q9R0B6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Lamc3Q9R0B6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Lamc3Q9R0B6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Lamc3Q9R0B6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Lamc3Q9R0B6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
Lamc3Q9R0B6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Lamc3Q9R0B6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Lamc3Q9R0B6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Lamc3Q9R0B6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Lamc3Q9R0B6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
Lamc3Q9R0B6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Lamc3Q9R0B6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Lamc3Q9R0B6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Lamc3Q9R0B6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Lamc3Q9R0B6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Lamc3Q9R0B6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Lamc3Q9R0B6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Lamc3Q9R0B6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Lamc3Q9R0B6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Lamc3Q9R0B6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Lamc3Q9R0B6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
Lamc3Q9R0B6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Lamc3Q9R0B6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Lamc3Q9R0B6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Lamc3Q9R0B6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Lamc3Q9R0B6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Lamc3Q9R0B6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Lamc3Q9R0B6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Lamc3Q9R0B6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Lamc3Q9R0B6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Lamc3Q9R0B6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Lamc3Q9R0B6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
Lamc3Q9R0B6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Lamc3Q9R0B6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Lamc3Q9R0B6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Lamc3Q9R0B6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Lamc3Q9R0B6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Lamc3Q9R0B6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Lamc3Q9R0B6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
Lamc3Q9R0B6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Lamc3Q9R0B6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Lamc3Q9R0B6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Lamc3Q9R0B6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
Lamc3Q9R0B6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Lamc3Q9R0B6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Lamc3Q9R0B6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Lamc3Q9R0B6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Lamc3Q9R0B6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Lamc3Q9R0B6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Lamc3Q9R0B6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Lamc3Q9R0B6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
Lamc3Q9R0B6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Lamc3Q9R0B6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Lamc3Q9R0B6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Lamc3Q9R0B6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
Lamc3Q9R0B6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Lamc3Q9R0B6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Lamc3Q9R0B6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
Lamc3Q9R0B6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Lamc3Q9R0B6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
Lamc3Q9R0B6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Lamc3Q9R0B6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Lamc3Q9R0B6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Lamc3Q9R0B6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
Lamc3Q9R0B6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Lamc3Q9R0B6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Lamc3Q9R0B6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Lamc3Q9R0B6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Lamc3Q9R0B6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Lamc3Q9R0B6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Lamc3Q9R0B6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Lamc3Q9R0B6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Lamc3Q9R0B6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Lamc3Q9R0B6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Lamc3Q9R0B6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Lamc3Q9R0B6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Lamc3Q9R0B6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Lamc3Q9R0B6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Lamc3Q9R0B6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms