Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prkab1Q9R078 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prkab1Q9R078 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prkab1Q9R078 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prkab1Q9R078 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prkab1Q9R078 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prkab1Q9R078 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prkab1Q9R078 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prkab1Q9R078 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prkab1Q9R078 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prkab1Q9R078 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prkab1Q9R078 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prkab1Q9R078 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prkab1Q9R078 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prkab1Q9R078 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prkab1Q9R078 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Prkab1Q9R078 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prkab1Q9R078 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prkab1Q9R078 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prkab1Q9R078 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prkab1Q9R078 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prkab1Q9R078 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prkab1Q9R078 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prkab1Q9R078 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prkab1Q9R078 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prkab1Q9R078 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prkab1Q9R078 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Prkab1Q9R078 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prkab1Q9R078 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prkab1Q9R078 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Prkab1Q9R078 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prkab1Q9R078 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prkab1Q9R078 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prkab1Q9R078 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prkab1Q9R078 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prkab1Q9R078 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prkab1Q9R078 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prkab1Q9R078 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prkab1Q9R078 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prkab1Q9R078 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prkab1Q9R078 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prkab1Q9R078 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prkab1Q9R078 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prkab1Q9R078 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prkab1Q9R078 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prkab1Q9R078 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prkab1Q9R078 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prkab1Q9R078 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prkab1Q9R078 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prkab1Q9R078 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prkab1Q9R078 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Prkab1Q9R078 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Prkab1Q9R078 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prkab1Q9R078 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prkab1Q9R078 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prkab1Q9R078 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prkab1Q9R078 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prkab1Q9R078 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prkab1Q9R078 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prkab1Q9R078 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prkab1Q9R078 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Prkab1Q9R078 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prkab1Q9R078 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prkab1Q9R078 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Prkab1Q9R078 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prkab1Q9R078 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Prkab1Q9R078 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prkab1Q9R078 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Prkab1Q9R078 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prkab1Q9R078 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prkab1Q9R078 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prkab1Q9R078 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Prkab1Q9R078 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prkab1Q9R078 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prkab1Q9R078 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prkab1Q9R078 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Prkab1Q9R078 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prkab1Q9R078 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prkab1Q9R078 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prkab1Q9R078 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prkab1Q9R078 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prkab1Q9R078 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prkab1Q9R078 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prkab1Q9R078 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prkab1Q9R078 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prkab1Q9R078 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prkab1Q9R078 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prkab1Q9R078 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Prkab1Q9R078 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prkab1Q9R078 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prkab1Q9R078 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prkab1Q9R078 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prkab1Q9R078 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prkab1Q9R078 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prkab1Q9R078 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prkab1Q9R078 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prkab1Q9R078 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prkab1Q9R078 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prkab1Q9R078 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prkab1Q9R078 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms