Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms