Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Gpc1Q9QZF2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpc1Q9QZF2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpc1Q9QZF2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpc1Q9QZF2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpc1Q9QZF2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpc1Q9QZF2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpc1Q9QZF2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpc1Q9QZF2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Gpc1Q9QZF2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Gpc1Q9QZF2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Gpc1Q9QZF2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpc1Q9QZF2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpc1Q9QZF2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpc1Q9QZF2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Gpc1Q9QZF2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpc1Q9QZF2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpc1Q9QZF2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Gpc1Q9QZF2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Gpc1Q9QZF2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpc1Q9QZF2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpc1Q9QZF2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpc1Q9QZF2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Gpc1Q9QZF2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gpc1Q9QZF2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gpc1Q9QZF2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpc1Q9QZF2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Gpc1Q9QZF2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpc1Q9QZF2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Gpc1Q9QZF2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Gpc1Q9QZF2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpc1Q9QZF2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Gpc1Q9QZF2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gpc1Q9QZF2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gpc1Q9QZF2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpc1Q9QZF2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpc1Q9QZF2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpc1Q9QZF2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Gpc1Q9QZF2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Gpc1Q9QZF2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gpc1Q9QZF2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gpc1Q9QZF2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gpc1Q9QZF2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gpc1Q9QZF2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gpc1Q9QZF2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gpc1Q9QZF2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gpc1Q9QZF2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gpc1Q9QZF2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gpc1Q9QZF2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpc1Q9QZF2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpc1Q9QZF2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpc1Q9QZF2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpc1Q9QZF2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpc1Q9QZF2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpc1Q9QZF2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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