Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE2

Clnk, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClnkQ9QZE2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ClnkQ9QZE2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ClnkQ9QZE2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ClnkQ9QZE2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ClnkQ9QZE2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ClnkQ9QZE2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ClnkQ9QZE2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ClnkQ9QZE2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ClnkQ9QZE2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ClnkQ9QZE2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ClnkQ9QZE2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ClnkQ9QZE2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClnkQ9QZE2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClnkQ9QZE2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClnkQ9QZE2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClnkQ9QZE2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClnkQ9QZE2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClnkQ9QZE2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ClnkQ9QZE2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClnkQ9QZE2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClnkQ9QZE2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClnkQ9QZE2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ClnkQ9QZE2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClnkQ9QZE2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClnkQ9QZE2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ClnkQ9QZE2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ClnkQ9QZE2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ClnkQ9QZE2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ClnkQ9QZE2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ClnkQ9QZE2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClnkQ9QZE2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClnkQ9QZE2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClnkQ9QZE2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ClnkQ9QZE2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ClnkQ9QZE2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ClnkQ9QZE2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ClnkQ9QZE2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ClnkQ9QZE2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ClnkQ9QZE2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ClnkQ9QZE2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms