Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rdh11Q9QYF1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rdh11Q9QYF1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rdh11Q9QYF1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rdh11Q9QYF1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdh11Q9QYF1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdh11Q9QYF1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdh11Q9QYF1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdh11Q9QYF1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdh11Q9QYF1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdh11Q9QYF1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdh11Q9QYF1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdh11Q9QYF1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdh11Q9QYF1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdh11Q9QYF1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdh11Q9QYF1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rdh11Q9QYF1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rdh11Q9QYF1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rdh11Q9QYF1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rdh11Q9QYF1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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Rdh11Q9QYF1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rdh11Q9QYF1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rdh11Q9QYF1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rdh11Q9QYF1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rdh11Q9QYF1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rdh11Q9QYF1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Rdh11Q9QYF1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Rdh11Q9QYF1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rdh11Q9QYF1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Rdh11Q9QYF1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rdh11Q9QYF1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rdh11Q9QYF1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rdh11Q9QYF1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Rdh11Q9QYF1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rdh11Q9QYF1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Rdh11Q9QYF1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rdh11Q9QYF1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Rdh11Q9QYF1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rdh11Q9QYF1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rdh11Q9QYF1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Rdh11Q9QYF1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Rdh11Q9QYF1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Rdh11Q9QYF1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rdh11Q9QYF1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Rdh11Q9QYF1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Rdh11Q9QYF1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rdh11Q9QYF1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rdh11Q9QYF1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rdh11Q9QYF1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rdh11Q9QYF1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rdh11Q9QYF1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rdh11Q9QYF1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rdh11Q9QYF1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rdh11Q9QYF1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rdh11Q9QYF1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rdh11Q9QYF1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rdh11Q9QYF1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rdh11Q9QYF1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rdh11Q9QYF1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rdh11Q9QYF1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rdh11Q9QYF1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rdh11Q9QYF1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rdh11Q9QYF1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rdh11Q9QYF1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rdh11Q9QYF1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rdh11Q9QYF1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rdh11Q9QYF1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rdh11Q9QYF1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rdh11Q9QYF1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rdh11Q9QYF1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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