Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY33

Tspan3, Tetraspanin-3, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3Q9QY33 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tspan3Q9QY33 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tspan3Q9QY33 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tspan3Q9QY33 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tspan3Q9QY33 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tspan3Q9QY33 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tspan3Q9QY33 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tspan3Q9QY33 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tspan3Q9QY33 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tspan3Q9QY33 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tspan3Q9QY33 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tspan3Q9QY33 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tspan3Q9QY33 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tspan3Q9QY33 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tspan3Q9QY33 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tspan3Q9QY33 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tspan3Q9QY33 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tspan3Q9QY33 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tspan3Q9QY33 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tspan3Q9QY33 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tspan3Q9QY33 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tspan3Q9QY33 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tspan3Q9QY33 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tspan3Q9QY33 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tspan3Q9QY33 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tspan3Q9QY33 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tspan3Q9QY33 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tspan3Q9QY33 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tspan3Q9QY33 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tspan3Q9QY33 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tspan3Q9QY33 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tspan3Q9QY33 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tspan3Q9QY33 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tspan3Q9QY33 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tspan3Q9QY33 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tspan3Q9QY33 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tspan3Q9QY33 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tspan3Q9QY33 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tspan3Q9QY33 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tspan3Q9QY33 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tspan3Q9QY33 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tspan3Q9QY33 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tspan3Q9QY33 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tspan3Q9QY33 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tspan3Q9QY33 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tspan3Q9QY33 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tspan3Q9QY33 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tspan3Q9QY33 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tspan3Q9QY33 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tspan3Q9QY33 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tspan3Q9QY33 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tspan3Q9QY33 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tspan3Q9QY33 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tspan3Q9QY33 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tspan3Q9QY33 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tspan3Q9QY33 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tspan3Q9QY33 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tspan3Q9QY33 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tspan3Q9QY33 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tspan3Q9QY33 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tspan3Q9QY33 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tspan3Q9QY33 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tspan3Q9QY33 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tspan3Q9QY33 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tspan3Q9QY33 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tspan3Q9QY33 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tspan3Q9QY33 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tspan3Q9QY33 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tspan3Q9QY33 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tspan3Q9QY33 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tspan3Q9QY33 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tspan3Q9QY33 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tspan3Q9QY33 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tspan3Q9QY33 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tspan3Q9QY33 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tspan3Q9QY33 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tspan3Q9QY33 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tspan3Q9QY33 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tspan3Q9QY33 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tspan3Q9QY33 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tspan3Q9QY33 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tspan3Q9QY33 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tspan3Q9QY33 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tspan3Q9QY33 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tspan3Q9QY33 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tspan3Q9QY33 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tspan3Q9QY33 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms