Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkp3Q9QY23 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkp3Q9QY23 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkp3Q9QY23 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkp3Q9QY23 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkp3Q9QY23 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkp3Q9QY23 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkp3Q9QY23 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkp3Q9QY23 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkp3Q9QY23 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkp3Q9QY23 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkp3Q9QY23 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkp3Q9QY23 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkp3Q9QY23 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkp3Q9QY23 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkp3Q9QY23 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkp3Q9QY23 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkp3Q9QY23 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkp3Q9QY23 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkp3Q9QY23 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkp3Q9QY23 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkp3Q9QY23 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkp3Q9QY23 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkp3Q9QY23 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkp3Q9QY23 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkp3Q9QY23 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkp3Q9QY23 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkp3Q9QY23 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkp3Q9QY23 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkp3Q9QY23 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkp3Q9QY23 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkp3Q9QY23 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkp3Q9QY23 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkp3Q9QY23 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkp3Q9QY23 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkp3Q9QY23 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkp3Q9QY23 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkp3Q9QY23 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkp3Q9QY23 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkp3Q9QY23 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkp3Q9QY23 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkp3Q9QY23 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkp3Q9QY23 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkp3Q9QY23 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkp3Q9QY23 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkp3Q9QY23 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkp3Q9QY23 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkp3Q9QY23 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkp3Q9QY23 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkp3Q9QY23 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkp3Q9QY23 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkp3Q9QY23 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkp3Q9QY23 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkp3Q9QY23 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkp3Q9QY23 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkp3Q9QY23 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkp3Q9QY23 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkp3Q9QY23 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkp3Q9QY23 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkp3Q9QY23 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pkp3Q9QY23 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pkp3Q9QY23 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pkp3Q9QY23 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pkp3Q9QY23 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pkp3Q9QY23 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkp3Q9QY23 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkp3Q9QY23 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkp3Q9QY23 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkp3Q9QY23 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkp3Q9QY23 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pkp3Q9QY23 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkp3Q9QY23 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkp3Q9QY23 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkp3Q9QY23 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkp3Q9QY23 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkp3Q9QY23 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkp3Q9QY23 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkp3Q9QY23 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkp3Q9QY23 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkp3Q9QY23 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkp3Q9QY23 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkp3Q9QY23 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkp3Q9QY23 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkp3Q9QY23 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkp3Q9QY23 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkp3Q9QY23 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkp3Q9QY23 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkp3Q9QY23 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkp3Q9QY23 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkp3Q9QY23 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkp3Q9QY23 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkp3Q9QY23 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkp3Q9QY23 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkp3Q9QY23 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkp3Q9QY23 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkp3Q9QY23 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkp3Q9QY23 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkp3Q9QY23 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkp3Q9QY23 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkp3Q9QY23 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms