Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXP7

C1qtnf1, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf1Q9QXP7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1qtnf1Q9QXP7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1qtnf1Q9QXP7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1qtnf1Q9QXP7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1qtnf1Q9QXP7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1qtnf1Q9QXP7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1qtnf1Q9QXP7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1qtnf1Q9QXP7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1qtnf1Q9QXP7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C1qtnf1Q9QXP7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1qtnf1Q9QXP7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1qtnf1Q9QXP7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1qtnf1Q9QXP7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1qtnf1Q9QXP7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1qtnf1Q9QXP7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1qtnf1Q9QXP7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1qtnf1Q9QXP7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1qtnf1Q9QXP7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1qtnf1Q9QXP7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1qtnf1Q9QXP7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1qtnf1Q9QXP7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1qtnf1Q9QXP7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1qtnf1Q9QXP7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1qtnf1Q9QXP7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1qtnf1Q9QXP7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1qtnf1Q9QXP7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1qtnf1Q9QXP7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1qtnf1Q9QXP7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1qtnf1Q9QXP7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1qtnf1Q9QXP7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1qtnf1Q9QXP7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1qtnf1Q9QXP7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1qtnf1Q9QXP7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1qtnf1Q9QXP7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1qtnf1Q9QXP7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1qtnf1Q9QXP7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1qtnf1Q9QXP7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1qtnf1Q9QXP7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1qtnf1Q9QXP7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1qtnf1Q9QXP7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1qtnf1Q9QXP7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1qtnf1Q9QXP7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1qtnf1Q9QXP7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1qtnf1Q9QXP7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1qtnf1Q9QXP7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1qtnf1Q9QXP7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1qtnf1Q9QXP7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1qtnf1Q9QXP7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1qtnf1Q9QXP7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1qtnf1Q9QXP7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
C1qtnf1Q9QXP7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
C1qtnf1Q9QXP7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1qtnf1Q9QXP7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1qtnf1Q9QXP7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C1qtnf1Q9QXP7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1qtnf1Q9QXP7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C1qtnf1Q9QXP7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1qtnf1Q9QXP7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1qtnf1Q9QXP7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1qtnf1Q9QXP7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C1qtnf1Q9QXP7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1qtnf1Q9QXP7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1qtnf1Q9QXP7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1qtnf1Q9QXP7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1qtnf1Q9QXP7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1qtnf1Q9QXP7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1qtnf1Q9QXP7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1qtnf1Q9QXP7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1qtnf1Q9QXP7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1qtnf1Q9QXP7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C1qtnf1Q9QXP7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1qtnf1Q9QXP7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1qtnf1Q9QXP7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C1qtnf1Q9QXP7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1qtnf1Q9QXP7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1qtnf1Q9QXP7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1qtnf1Q9QXP7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1qtnf1Q9QXP7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1qtnf1Q9QXP7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1qtnf1Q9QXP7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1qtnf1Q9QXP7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C1qtnf1Q9QXP7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C1qtnf1Q9QXP7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1qtnf1Q9QXP7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1qtnf1Q9QXP7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1qtnf1Q9QXP7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1qtnf1Q9QXP7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1qtnf1Q9QXP7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1qtnf1Q9QXP7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1qtnf1Q9QXP7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1qtnf1Q9QXP7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1qtnf1Q9QXP7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1qtnf1Q9QXP7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1qtnf1Q9QXP7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1qtnf1Q9QXP7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1qtnf1Q9QXP7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1qtnf1Q9QXP7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1qtnf1Q9QXP7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1qtnf1Q9QXP7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1qtnf1Q9QXP7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms