Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUQ5

Trpc4, Short transient receptor potential channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4Q9QUQ5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpc4Q9QUQ5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpc4Q9QUQ5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpc4Q9QUQ5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpc4Q9QUQ5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpc4Q9QUQ5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms