Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Psma6Q9QUM9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Psma6Q9QUM9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Psma6Q9QUM9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Psma6Q9QUM9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Psma6Q9QUM9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Psma6Q9QUM9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psma6Q9QUM9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psma6Q9QUM9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psma6Q9QUM9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psma6Q9QUM9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psma6Q9QUM9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psma6Q9QUM9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psma6Q9QUM9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psma6Q9QUM9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psma6Q9QUM9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psma6Q9QUM9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psma6Q9QUM9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psma6Q9QUM9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psma6Q9QUM9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psma6Q9QUM9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psma6Q9QUM9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Psma6Q9QUM9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psma6Q9QUM9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psma6Q9QUM9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psma6Q9QUM9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psma6Q9QUM9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psma6Q9QUM9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psma6Q9QUM9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psma6Q9QUM9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Psma6Q9QUM9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psma6Q9QUM9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psma6Q9QUM9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psma6Q9QUM9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psma6Q9QUM9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Psma6Q9QUM9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psma6Q9QUM9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psma6Q9QUM9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psma6Q9QUM9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psma6Q9QUM9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psma6Q9QUM9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psma6Q9QUM9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psma6Q9QUM9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psma6Q9QUM9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psma6Q9QUM9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psma6Q9QUM9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psma6Q9QUM9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psma6Q9QUM9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psma6Q9QUM9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psma6Q9QUM9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psma6Q9QUM9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psma6Q9QUM9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psma6Q9QUM9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psma6Q9QUM9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psma6Q9QUM9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psma6Q9QUM9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psma6Q9QUM9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms