Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB8

Cntn6, Contactin-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn6Q9JMB8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cntn6Q9JMB8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cntn6Q9JMB8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cntn6Q9JMB8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cntn6Q9JMB8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cntn6Q9JMB8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cntn6Q9JMB8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntn6Q9JMB8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntn6Q9JMB8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntn6Q9JMB8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntn6Q9JMB8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntn6Q9JMB8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cntn6Q9JMB8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cntn6Q9JMB8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cntn6Q9JMB8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cntn6Q9JMB8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cntn6Q9JMB8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cntn6Q9JMB8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cntn6Q9JMB8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cntn6Q9JMB8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cntn6Q9JMB8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cntn6Q9JMB8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cntn6Q9JMB8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cntn6Q9JMB8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cntn6Q9JMB8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cntn6Q9JMB8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cntn6Q9JMB8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cntn6Q9JMB8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cntn6Q9JMB8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cntn6Q9JMB8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cntn6Q9JMB8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cntn6Q9JMB8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cntn6Q9JMB8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cntn6Q9JMB8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntn6Q9JMB8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntn6Q9JMB8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntn6Q9JMB8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntn6Q9JMB8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntn6Q9JMB8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntn6Q9JMB8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntn6Q9JMB8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntn6Q9JMB8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntn6Q9JMB8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cntn6Q9JMB8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cntn6Q9JMB8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cntn6Q9JMB8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntn6Q9JMB8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntn6Q9JMB8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntn6Q9JMB8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntn6Q9JMB8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntn6Q9JMB8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntn6Q9JMB8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntn6Q9JMB8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntn6Q9JMB8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cntn6Q9JMB8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cntn6Q9JMB8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cntn6Q9JMB8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cntn6Q9JMB8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cntn6Q9JMB8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cntn6Q9JMB8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cntn6Q9JMB8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cntn6Q9JMB8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cntn6Q9JMB8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cntn6Q9JMB8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cntn6Q9JMB8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cntn6Q9JMB8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cntn6Q9JMB8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cntn6Q9JMB8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cntn6Q9JMB8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cntn6Q9JMB8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cntn6Q9JMB8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cntn6Q9JMB8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cntn6Q9JMB8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cntn6Q9JMB8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cntn6Q9JMB8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cntn6Q9JMB8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cntn6Q9JMB8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cntn6Q9JMB8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cntn6Q9JMB8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cntn6Q9JMB8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cntn6Q9JMB8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cntn6Q9JMB8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cntn6Q9JMB8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntn6Q9JMB8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntn6Q9JMB8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntn6Q9JMB8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntn6Q9JMB8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntn6Q9JMB8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntn6Q9JMB8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cntn6Q9JMB8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cntn6Q9JMB8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cntn6Q9JMB8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cntn6Q9JMB8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cntn6Q9JMB8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cntn6Q9JMB8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cntn6Q9JMB8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cntn6Q9JMB8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cntn6Q9JMB8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cntn6Q9JMB8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cntn6Q9JMB8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms