Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLQ0

Cd2ap, CD2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd2apQ9JLQ0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cd2apQ9JLQ0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cd2apQ9JLQ0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cd2apQ9JLQ0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cd2apQ9JLQ0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cd2apQ9JLQ0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cd2apQ9JLQ0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cd2apQ9JLQ0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cd2apQ9JLQ0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cd2apQ9JLQ0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cd2apQ9JLQ0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cd2apQ9JLQ0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cd2apQ9JLQ0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cd2apQ9JLQ0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cd2apQ9JLQ0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cd2apQ9JLQ0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cd2apQ9JLQ0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cd2apQ9JLQ0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cd2apQ9JLQ0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cd2apQ9JLQ0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cd2apQ9JLQ0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cd2apQ9JLQ0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cd2apQ9JLQ0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cd2apQ9JLQ0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cd2apQ9JLQ0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cd2apQ9JLQ0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cd2apQ9JLQ0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cd2apQ9JLQ0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cd2apQ9JLQ0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cd2apQ9JLQ0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cd2apQ9JLQ0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cd2apQ9JLQ0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cd2apQ9JLQ0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cd2apQ9JLQ0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cd2apQ9JLQ0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cd2apQ9JLQ0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cd2apQ9JLQ0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cd2apQ9JLQ0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cd2apQ9JLQ0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cd2apQ9JLQ0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cd2apQ9JLQ0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cd2apQ9JLQ0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cd2apQ9JLQ0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cd2apQ9JLQ0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Cd2apQ9JLQ0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cd2apQ9JLQ0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cd2apQ9JLQ0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cd2apQ9JLQ0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cd2apQ9JLQ0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cd2apQ9JLQ0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cd2apQ9JLQ0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cd2apQ9JLQ0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cd2apQ9JLQ0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cd2apQ9JLQ0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cd2apQ9JLQ0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cd2apQ9JLQ0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cd2apQ9JLQ0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cd2apQ9JLQ0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cd2apQ9JLQ0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cd2apQ9JLQ0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cd2apQ9JLQ0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cd2apQ9JLQ0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cd2apQ9JLQ0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cd2apQ9JLQ0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cd2apQ9JLQ0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cd2apQ9JLQ0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cd2apQ9JLQ0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cd2apQ9JLQ0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cd2apQ9JLQ0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cd2apQ9JLQ0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cd2apQ9JLQ0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cd2apQ9JLQ0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cd2apQ9JLQ0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cd2apQ9JLQ0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cd2apQ9JLQ0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cd2apQ9JLQ0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cd2apQ9JLQ0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cd2apQ9JLQ0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cd2apQ9JLQ0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cd2apQ9JLQ0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cd2apQ9JLQ0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cd2apQ9JLQ0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cd2apQ9JLQ0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cd2apQ9JLQ0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cd2apQ9JLQ0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cd2apQ9JLQ0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cd2apQ9JLQ0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cd2apQ9JLQ0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cd2apQ9JLQ0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cd2apQ9JLQ0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cd2apQ9JLQ0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cd2apQ9JLQ0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cd2apQ9JLQ0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cd2apQ9JLQ0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cd2apQ9JLQ0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cd2apQ9JLQ0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cd2apQ9JLQ0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cd2apQ9JLQ0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cd2apQ9JLQ0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cd2apQ9JLQ0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms