Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dclk1Q9JLM8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Dclk1Q9JLM8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Dclk1Q9JLM8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dclk1Q9JLM8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dclk1Q9JLM8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Dclk1Q9JLM8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Dclk1Q9JLM8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dclk1Q9JLM8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dclk1Q9JLM8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dclk1Q9JLM8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dclk1Q9JLM8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dclk1Q9JLM8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dclk1Q9JLM8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dclk1Q9JLM8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Dclk1Q9JLM8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Dclk1Q9JLM8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dclk1Q9JLM8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dclk1Q9JLM8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dclk1Q9JLM8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Dclk1Q9JLM8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Dclk1Q9JLM8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dclk1Q9JLM8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dclk1Q9JLM8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dclk1Q9JLM8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dclk1Q9JLM8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dclk1Q9JLM8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dclk1Q9JLM8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dclk1Q9JLM8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dclk1Q9JLM8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Dclk1Q9JLM8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dclk1Q9JLM8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dclk1Q9JLM8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dclk1Q9JLM8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dclk1Q9JLM8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dclk1Q9JLM8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dclk1Q9JLM8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dclk1Q9JLM8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dclk1Q9JLM8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dclk1Q9JLM8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dclk1Q9JLM8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dclk1Q9JLM8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dclk1Q9JLM8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dclk1Q9JLM8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dclk1Q9JLM8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dclk1Q9JLM8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dclk1Q9JLM8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dclk1Q9JLM8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dclk1Q9JLM8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dclk1Q9JLM8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dclk1Q9JLM8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dclk1Q9JLM8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dclk1Q9JLM8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dclk1Q9JLM8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dclk1Q9JLM8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dclk1Q9JLM8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dclk1Q9JLM8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dclk1Q9JLM8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Dclk1Q9JLM8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Dclk1Q9JLM8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dclk1Q9JLM8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dclk1Q9JLM8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dclk1Q9JLM8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dclk1Q9JLM8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dclk1Q9JLM8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dclk1Q9JLM8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dclk1Q9JLM8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dclk1Q9JLM8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Dclk1Q9JLM8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dclk1Q9JLM8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dclk1Q9JLM8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dclk1Q9JLM8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dclk1Q9JLM8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dclk1Q9JLM8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Dclk1Q9JLM8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dclk1Q9JLM8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Dclk1Q9JLM8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dclk1Q9JLM8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dclk1Q9JLM8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Dclk1Q9JLM8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dclk1Q9JLM8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dclk1Q9JLM8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dclk1Q9JLM8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Dclk1Q9JLM8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dclk1Q9JLM8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dclk1Q9JLM8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dclk1Q9JLM8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dclk1Q9JLM8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dclk1Q9JLM8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Dclk1Q9JLM8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dclk1Q9JLM8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dclk1Q9JLM8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Dclk1Q9JLM8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dclk1Q9JLM8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dclk1Q9JLM8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dclk1Q9JLM8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dclk1Q9JLM8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dclk1Q9JLM8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dclk1Q9JLM8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dclk1Q9JLM8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms