Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prg3Q9JL95 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Prg3Q9JL95 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prg3Q9JL95 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prg3Q9JL95 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prg3Q9JL95 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prg3Q9JL95 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prg3Q9JL95 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prg3Q9JL95 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prg3Q9JL95 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prg3Q9JL95 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prg3Q9JL95 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prg3Q9JL95 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prg3Q9JL95 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prg3Q9JL95 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Prg3Q9JL95 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Prg3Q9JL95 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prg3Q9JL95 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prg3Q9JL95 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prg3Q9JL95 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prg3Q9JL95 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prg3Q9JL95 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prg3Q9JL95 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prg3Q9JL95 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prg3Q9JL95 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prg3Q9JL95 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prg3Q9JL95 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prg3Q9JL95 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prg3Q9JL95 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prg3Q9JL95 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prg3Q9JL95 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prg3Q9JL95 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prg3Q9JL95 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prg3Q9JL95 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prg3Q9JL95 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prg3Q9JL95 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prg3Q9JL95 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prg3Q9JL95 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prg3Q9JL95 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prg3Q9JL95 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prg3Q9JL95 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prg3Q9JL95 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Prg3Q9JL95 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prg3Q9JL95 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prg3Q9JL95 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prg3Q9JL95 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Prg3Q9JL95 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prg3Q9JL95 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prg3Q9JL95 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prg3Q9JL95 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prg3Q9JL95 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prg3Q9JL95 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Prg3Q9JL95 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prg3Q9JL95 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prg3Q9JL95 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prg3Q9JL95 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prg3Q9JL95 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prg3Q9JL95 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prg3Q9JL95 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prg3Q9JL95 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prg3Q9JL95 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prg3Q9JL95 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Prg3Q9JL95 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Prg3Q9JL95 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prg3Q9JL95 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prg3Q9JL95 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prg3Q9JL95 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Prg3Q9JL95 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prg3Q9JL95 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prg3Q9JL95 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prg3Q9JL95 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prg3Q9JL95 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prg3Q9JL95 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prg3Q9JL95 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Prg3Q9JL95 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prg3Q9JL95 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prg3Q9JL95 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prg3Q9JL95 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prg3Q9JL95 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prg3Q9JL95 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prg3Q9JL95 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prg3Q9JL95 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prg3Q9JL95 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prg3Q9JL95 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prg3Q9JL95 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prg3Q9JL95 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prg3Q9JL95 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prg3Q9JL95 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prg3Q9JL95 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prg3Q9JL95 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prg3Q9JL95 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prg3Q9JL95 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prg3Q9JL95 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prg3Q9JL95 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prg3Q9JL95 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prg3Q9JL95 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prg3Q9JL95 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prg3Q9JL95 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Prg3Q9JL95 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prg3Q9JL95 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms