Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc5a3Q9JKZ2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc5a3Q9JKZ2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc5a3Q9JKZ2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc5a3Q9JKZ2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc5a3Q9JKZ2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc5a3Q9JKZ2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc5a3Q9JKZ2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Slc5a3Q9JKZ2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc5a3Q9JKZ2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc5a3Q9JKZ2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc5a3Q9JKZ2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc5a3Q9JKZ2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc5a3Q9JKZ2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc5a3Q9JKZ2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc5a3Q9JKZ2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc5a3Q9JKZ2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc5a3Q9JKZ2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc5a3Q9JKZ2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc5a3Q9JKZ2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc5a3Q9JKZ2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc5a3Q9JKZ2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc5a3Q9JKZ2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc5a3Q9JKZ2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc5a3Q9JKZ2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc5a3Q9JKZ2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc5a3Q9JKZ2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc5a3Q9JKZ2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc5a3Q9JKZ2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc5a3Q9JKZ2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc5a3Q9JKZ2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc5a3Q9JKZ2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc5a3Q9JKZ2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc5a3Q9JKZ2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc5a3Q9JKZ2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc5a3Q9JKZ2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc5a3Q9JKZ2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Slc5a3Q9JKZ2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc5a3Q9JKZ2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc5a3Q9JKZ2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc5a3Q9JKZ2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc5a3Q9JKZ2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc5a3Q9JKZ2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc5a3Q9JKZ2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc5a3Q9JKZ2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc5a3Q9JKZ2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc5a3Q9JKZ2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc5a3Q9JKZ2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc5a3Q9JKZ2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc5a3Q9JKZ2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc5a3Q9JKZ2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc5a3Q9JKZ2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc5a3Q9JKZ2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc5a3Q9JKZ2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc5a3Q9JKZ2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms