Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ppp1r3fQ9JIG4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ppp1r3fQ9JIG4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ppp1r3fQ9JIG4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ppp1r3fQ9JIG4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ppp1r3fQ9JIG4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ppp1r3fQ9JIG4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ppp1r3fQ9JIG4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ppp1r3fQ9JIG4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ppp1r3fQ9JIG4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ppp1r3fQ9JIG4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppp1r3fQ9JIG4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppp1r3fQ9JIG4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppp1r3fQ9JIG4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppp1r3fQ9JIG4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppp1r3fQ9JIG4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppp1r3fQ9JIG4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppp1r3fQ9JIG4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppp1r3fQ9JIG4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppp1r3fQ9JIG4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppp1r3fQ9JIG4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ppp1r3fQ9JIG4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ppp1r3fQ9JIG4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ppp1r3fQ9JIG4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ppp1r3fQ9JIG4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ppp1r3fQ9JIG4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppp1r3fQ9JIG4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppp1r3fQ9JIG4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppp1r3fQ9JIG4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppp1r3fQ9JIG4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppp1r3fQ9JIG4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppp1r3fQ9JIG4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ppp1r3fQ9JIG4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ppp1r3fQ9JIG4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ppp1r3fQ9JIG4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ppp1r3fQ9JIG4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ppp1r3fQ9JIG4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ppp1r3fQ9JIG4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ppp1r3fQ9JIG4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ppp1r3fQ9JIG4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ppp1r3fQ9JIG4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ppp1r3fQ9JIG4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ppp1r3fQ9JIG4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ppp1r3fQ9JIG4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ppp1r3fQ9JIG4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ppp1r3fQ9JIG4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ppp1r3fQ9JIG4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms