Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI08

Bin3, Bridging integrator 3, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bin3Q9JI08 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bin3Q9JI08 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bin3Q9JI08 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bin3Q9JI08 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bin3Q9JI08 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bin3Q9JI08 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bin3Q9JI08 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bin3Q9JI08 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bin3Q9JI08 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bin3Q9JI08 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bin3Q9JI08 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bin3Q9JI08 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bin3Q9JI08 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bin3Q9JI08 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bin3Q9JI08 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bin3Q9JI08 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bin3Q9JI08 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bin3Q9JI08 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bin3Q9JI08 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bin3Q9JI08 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bin3Q9JI08 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bin3Q9JI08 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bin3Q9JI08 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bin3Q9JI08 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bin3Q9JI08 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bin3Q9JI08 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bin3Q9JI08 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bin3Q9JI08 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bin3Q9JI08 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bin3Q9JI08 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bin3Q9JI08 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bin3Q9JI08 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bin3Q9JI08 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bin3Q9JI08 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bin3Q9JI08 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bin3Q9JI08 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bin3Q9JI08 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bin3Q9JI08 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Bin3Q9JI08 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bin3Q9JI08 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bin3Q9JI08 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bin3Q9JI08 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bin3Q9JI08 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bin3Q9JI08 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bin3Q9JI08 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bin3Q9JI08 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bin3Q9JI08 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bin3Q9JI08 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bin3Q9JI08 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bin3Q9JI08 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bin3Q9JI08 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bin3Q9JI08 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bin3Q9JI08 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bin3Q9JI08 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms