Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW9

Aldh1a3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a3Q9JHW9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aldh1a3Q9JHW9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aldh1a3Q9JHW9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Aldh1a3Q9JHW9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Aldh1a3Q9JHW9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Aldh1a3Q9JHW9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Aldh1a3Q9JHW9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Aldh1a3Q9JHW9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aldh1a3Q9JHW9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aldh1a3Q9JHW9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aldh1a3Q9JHW9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aldh1a3Q9JHW9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aldh1a3Q9JHW9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aldh1a3Q9JHW9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Aldh1a3Q9JHW9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Aldh1a3Q9JHW9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aldh1a3Q9JHW9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aldh1a3Q9JHW9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aldh1a3Q9JHW9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aldh1a3Q9JHW9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aldh1a3Q9JHW9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aldh1a3Q9JHW9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aldh1a3Q9JHW9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aldh1a3Q9JHW9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aldh1a3Q9JHW9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aldh1a3Q9JHW9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aldh1a3Q9JHW9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aldh1a3Q9JHW9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aldh1a3Q9JHW9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aldh1a3Q9JHW9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aldh1a3Q9JHW9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aldh1a3Q9JHW9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aldh1a3Q9JHW9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aldh1a3Q9JHW9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aldh1a3Q9JHW9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aldh1a3Q9JHW9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aldh1a3Q9JHW9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aldh1a3Q9JHW9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aldh1a3Q9JHW9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aldh1a3Q9JHW9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aldh1a3Q9JHW9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aldh1a3Q9JHW9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aldh1a3Q9JHW9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aldh1a3Q9JHW9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aldh1a3Q9JHW9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aldh1a3Q9JHW9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aldh1a3Q9JHW9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aldh1a3Q9JHW9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aldh1a3Q9JHW9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aldh1a3Q9JHW9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Aldh1a3Q9JHW9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Aldh1a3Q9JHW9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aldh1a3Q9JHW9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aldh1a3Q9JHW9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1a3Q9JHW9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1a3Q9JHW9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms