Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EefsecQ9JHW4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EefsecQ9JHW4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EefsecQ9JHW4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EefsecQ9JHW4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EefsecQ9JHW4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EefsecQ9JHW4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EefsecQ9JHW4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EefsecQ9JHW4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EefsecQ9JHW4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EefsecQ9JHW4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EefsecQ9JHW4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EefsecQ9JHW4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EefsecQ9JHW4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EefsecQ9JHW4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EefsecQ9JHW4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EefsecQ9JHW4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EefsecQ9JHW4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EefsecQ9JHW4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EefsecQ9JHW4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EefsecQ9JHW4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EefsecQ9JHW4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EefsecQ9JHW4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EefsecQ9JHW4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EefsecQ9JHW4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EefsecQ9JHW4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EefsecQ9JHW4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EefsecQ9JHW4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EefsecQ9JHW4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms