Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHE7

Tssc4, Protein TSSC4, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssc4Q9JHE7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tssc4Q9JHE7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tssc4Q9JHE7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tssc4Q9JHE7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tssc4Q9JHE7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tssc4Q9JHE7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tssc4Q9JHE7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tssc4Q9JHE7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tssc4Q9JHE7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tssc4Q9JHE7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tssc4Q9JHE7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tssc4Q9JHE7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tssc4Q9JHE7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tssc4Q9JHE7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tssc4Q9JHE7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tssc4Q9JHE7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tssc4Q9JHE7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tssc4Q9JHE7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tssc4Q9JHE7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tssc4Q9JHE7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tssc4Q9JHE7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tssc4Q9JHE7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tssc4Q9JHE7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tssc4Q9JHE7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tssc4Q9JHE7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tssc4Q9JHE7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tssc4Q9JHE7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tssc4Q9JHE7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tssc4Q9JHE7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tssc4Q9JHE7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tssc4Q9JHE7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tssc4Q9JHE7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tssc4Q9JHE7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tssc4Q9JHE7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tssc4Q9JHE7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tssc4Q9JHE7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tssc4Q9JHE7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tssc4Q9JHE7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tssc4Q9JHE7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tssc4Q9JHE7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tssc4Q9JHE7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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Tssc4Q9JHE7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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Tssc4Q9JHE7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tssc4Q9JHE7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tssc4Q9JHE7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tssc4Q9JHE7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tssc4Q9JHE7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tssc4Q9JHE7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tssc4Q9JHE7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tssc4Q9JHE7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tssc4Q9JHE7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tssc4Q9JHE7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tssc4Q9JHE7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.32■■□□□ 1
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Tssc4Q9JHE7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tssc4Q9JHE7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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Tssc4Q9JHE7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tssc4Q9JHE7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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Tssc4Q9JHE7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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Tssc4Q9JHE7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tssc4Q9JHE7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tssc4Q9JHE7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tssc4Q9JHE7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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Tssc4Q9JHE7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tssc4Q9JHE7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tssc4Q9JHE7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tssc4Q9JHE7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tssc4Q9JHE7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tssc4Q9JHE7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tssc4Q9JHE7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tssc4Q9JHE7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tssc4Q9JHE7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tssc4Q9JHE7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tssc4Q9JHE7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tssc4Q9JHE7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tssc4Q9JHE7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tssc4Q9JHE7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tssc4Q9JHE7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tssc4Q9JHE7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tssc4Q9JHE7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tssc4Q9JHE7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tssc4Q9JHE7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tssc4Q9JHE7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tssc4Q9JHE7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tssc4Q9JHE7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tssc4Q9JHE7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tssc4Q9JHE7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tssc4Q9JHE7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tssc4Q9JHE7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tssc4Q9JHE7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tssc4Q9JHE7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
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