Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DysfQ9ESD7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DysfQ9ESD7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DysfQ9ESD7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms