Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dap3Q9ER88 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Dap3Q9ER88 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dap3Q9ER88 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dap3Q9ER88 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dap3Q9ER88 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dap3Q9ER88 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dap3Q9ER88 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dap3Q9ER88 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dap3Q9ER88 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dap3Q9ER88 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dap3Q9ER88 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms