Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQU3

Tlr9, Toll-like receptor 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr9Q9EQU3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tlr9Q9EQU3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tlr9Q9EQU3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tlr9Q9EQU3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr9Q9EQU3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr9Q9EQU3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr9Q9EQU3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr9Q9EQU3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr9Q9EQU3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr9Q9EQU3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr9Q9EQU3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr9Q9EQU3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr9Q9EQU3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr9Q9EQU3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr9Q9EQU3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr9Q9EQU3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr9Q9EQU3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr9Q9EQU3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr9Q9EQU3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr9Q9EQU3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr9Q9EQU3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr9Q9EQU3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tlr9Q9EQU3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr9Q9EQU3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr9Q9EQU3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr9Q9EQU3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr9Q9EQU3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr9Q9EQU3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr9Q9EQU3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr9Q9EQU3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr9Q9EQU3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tlr9Q9EQU3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tlr9Q9EQU3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tlr9Q9EQU3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tlr9Q9EQU3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr9Q9EQU3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr9Q9EQU3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr9Q9EQU3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr9Q9EQU3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr9Q9EQU3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr9Q9EQU3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr9Q9EQU3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr9Q9EQU3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr9Q9EQU3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr9Q9EQU3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr9Q9EQU3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr9Q9EQU3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr9Q9EQU3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr9Q9EQU3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr9Q9EQU3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr9Q9EQU3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr9Q9EQU3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr9Q9EQU3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr9Q9EQU3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr9Q9EQU3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr9Q9EQU3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr9Q9EQU3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr9Q9EQU3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr9Q9EQU3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr9Q9EQU3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr9Q9EQU3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr9Q9EQU3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr9Q9EQU3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr9Q9EQU3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr9Q9EQU3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr9Q9EQU3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr9Q9EQU3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr9Q9EQU3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms